自分の好きなディレクトリにアクセス制御をかけたいのですができますか。

申し訳ありませんが自分の好きなディレクトリにアクセス制御を設定することはできません。アクセス制御が設定できるのは、public_htmlの直下にある「private」ディレクトリのみとなります。